首都癫痫及精神外科治疗中心成立于2006年12月，其前身为成立于2001年的首都癫痫外科治疗中心。中心基础隶属于解放军总医院第一附属医院神经外科。
解放军总医院第一附属医院是创建于1954年的军队综合性三级甲等医院，开展床位1000余张，年手术量10000余台，在国内外有较高知名度。神经外科是医院的重点科室之一，有两个病区、70张床位，下辖首都癫痫与精神外科中心、首都脑胶质瘤治疗中心、脑血管病外科治疗中心，以癫痫与精神疾病的外科治疗、脑胶质瘤的新综合治疗、脑血管病的手术治疗和颅脑创伤的救治为主要特色。
中心基础是解放军总医院第一附属医院（原304医院）神经外科功能组，并聘请了另外4名神经、精神和脑成像专家作为门诊及会诊专家，每周进行术前病例的会诊讨论。中心现有主任医师2名、副主任医师4名、主治医生2名、医师2名、技师3名。同时还聘请了由中华神经外科学会主任王忠诚院士、我国军队神经外开拓者、人民解放军一级红旗勋章获得者涂通今将军、美国阿肯色大学Boop教授为主任委员、国内著名癫痫外科专家谭启富教授为常务副主任委员的学术顾问委员会，该委员会包括了全国32个省市自治区的著名神经内外科专家。中心引进了欧洲生产的2001年度国际最新型全数字化偶极子定位、三维图像融合长程视频脑电监测系统（俗称癫痫刀）；2007年又引进了美国最新的全套数字化脑电图系统和瑞典Leksel头架和立体定向计划系统。中心现已经形成拥有多套视频脑电图、动态脑电图、立体定向计划系统、头架、百级层流手术室、1.5TMRI、16排CT、PET、SPECT、MRS、心理CT、认知测评仪等完整的癫痫定位及精神疾病检查和功能神经外科治疗体系。现已完成癫痫外科手术643例、癫痫性精神障碍手术54例，精神分裂症、精神发育迟滞、强迫症等手术61例，有效率在90%以上。相关内容在国内外杂志发表文章30余篇，其中SCI收录2篇。还获得军队医疗成果奖3项、科技进步奖1项。